La struttura organizzativa regionale rappresenta l'apparato amministrativo di supporto a quello istituzionale.
Con deliberazione n. 574 del 18 dicembre 2018 la Giunta regionale ha approvato l'Atto di organizzazione delle strutture dirigenziali della Giunta regionale, in applicazione dell'articolo 5, comma 2, della legge regionale 23 marzo 2010, n. 10.
In seguito, sono stati approvati i seguenti provvedimenti di modifica e/o integrazione della D.G.R. n. 574/2018:
deliberazioni n. 71 dell'11 marzo 2019, n. 306 e n. 307 del 9 agosto 2019, n. 348 del 19 settembre 2019, n. 523 del 20 dicembre 2019, n. 186 del 25 giugno 2021, n. 274 del 12 agosto 2021, n. 311 del 20 settembre 2021, n. 329 del 5 ottobre 2021, n. 410 del 2 dicembre 2021, n. 118 del 21 aprile 2022 e n. 235 del 14 luglio 2022
Servizi "autonomi" della Presidenza della Giunta Regionale
Segretariato regionale
D. I- PRIMO DIPARTIMENTO DELLA PRESIDENZA DELLA GIUNTA REGIONALE
D. II- SECONDO DIPARTIMENTO RISORSE FINANZIARIE - VALORIZZAZIONE AMBIENTE E RISORSE NATURALI - SISTEMA REGIONALE E AUTONOMIE LOCALI
D. III - TERZO DIPARTIMENTO VALORIZZAZIONE DEL CAPITALE UMANO
D. IV - QUARTO DIPARTIMENTO GOVERNO DEL TERRITORIO
Direzione Generale per la Salute
Agenzia Regionale Molise Lavoro
Autoritą di bacino
ESU - Ente per il diritto allo Studio Universitario
Fondazione Molise Cultura
IRESMO - l'Istituto Regionale per gli Studi Storici del Molise
Segreterie particolari